Gastroskopi, radyolojik teknikler ile net olarak ortaya çıkarılamayan hastalıkların (mukoza iltihapları-anormallikleri ve kanama gibi) direkt görüntüyle saptanmasını ve bu şekilde sorunun daha iyi anlaşılıp, geç kalınmaksızın çözümünü sağlar. Gastroskopik inceleme yutma güçlüğü, bulantı, kusma, reflü, kanama, hazımsızlık, karın ve göğüs ağrısı gibi çeşitli belirtilerin ve radyolojik olarak anormal bulguların nedeninin araştırılmasında uygulanabilir. Endoskopi işlemi sırasında, gastroskop içinden gönderilen ince bir tel yardımıyla doku örneği alınabilir (biyopsi), polip çıkartılabilir (polipektomi) yada kanayan bölgelere müdahale yapılabilir (skleroterapi). Tüm bu işlemler sırasında hasta hiçbir ağrı duymaz. Ayrıca bazı boyalar (metilen mavisi, lugol ve indigo) yardımı ile kromoendoskopi (boyamalı endoskopi) yapılabilir, bu da görülen bazı lezyonların ayırıcı tanısının yardımına ve uygun biyopsi örneklerinin alınmasına olanak sağlar. Kromoendoskopi işlem süresini 10-15 dakika uzatır, fakat ek rahatsızlık vermez.